Hvis man ønsker å jobbe sammen i et EndNote bibliotek, så kan man gjøre dette gjennom "Library Sharing" funksjonen. Det anbefales at man oppretter et nytt bibliotek for dette formålet, men hvis du bruker ditt eget er det viktig at du lager en backup av ditt eget biblioteket før du setter i gang. (Si ja på forespørselen om å lage en "compressed library backup"). Alle som ønsker å ta del i et delt bibliotek må ha en EndNote online-konto og EndNote X7.2 eller en senere versjon.

Slik gjør du det:

Opprett en EndNote online-konto.
Opprett et bibliotek i EndNote desktop som kan brukes til samarbeid.
Synkronisér desktop-biblioteket ditt med EndNote online ved å trykke på "Sync" knappen øverst i venstre hjørnet, eller gå til "Tools" og "Sync". Logg inn med brukernavnet du lagde tidligere.
I EndNote desktop, klikk på "Share Library"-knappen eller gå på "File" og "Share". Legg inn e-postadressene til de du ønsker å dele biblioteket med. Klikk på "Invite" knappen. Merk deg at du her kan bestemme om medlemmene skal ha tilgang til å bruke og endre referansene i biblioteket ditt, "Read & Write", eller om de bare skal ha tilgang uten å kunne endre på noe, "Read Only".

De du har invitert får nå en e-post fra EndNote med emne "Invitation to share an EndNote library", og her må de akseptere og logge seg inn med sin egen EndNote online-konto.

Samarbeidspartene får tilgang til det delte biblioteket ved å trykke på "File", "Open Shared Library" og velg riktig bibliotek. Alle deltakere kan endre på referansene i biblioteket.

Viktige huskeregler når du deler et EndNote-bibliotek:

Ta backup av biblioteket ditt før du deler. (Si ja til forespørselen om å lage en "compressed library backup").
Du kan kun dele et bibliotek om gangen, men du kan delta i flere delte bibliotek.
Et høyt antall referanser eller mange PDF-filer i biblioteket ditt kan ta stor plass, og kan gjøre synkroniseringen tregere enn nødvendig.
Pass på at når du vil dele et nytt bibliotek, så må du slette de gamle referansene manuelt fra EndNote Web for å unngå sammenslåing av bibliotekene. Husk å tømme søpla også, da disse referansene også synkroniseres.
Hvis du eller den du jobber med har brukt en referanse i et dokument, vil du ikke få advarsel om dette hvis du sletter/endrer på den. Referansen blir værende i dokumentet til vedkommende som en "Traveling Library" referanse, noe som kan medføre problemer senere i oppgaven. Vær dermed forsiktig med å slette referanser!
Du må synkronisere biblioteket hver gang du har gjort endringer. De du deler bibliotek med må også synkronisere biblioteket for å se endringene.
Hvis dere er flere som legger referanser inn i biblioteket, bør eieren kjøre duplikatsjekk jevnlig.